Bioinformatik

Die Arbeitsgruppe Computational Biology und Bioinformatik  am Institut für Medizinische Genetik der Charité-Universitätsmedizin Berlin entwickelt Algorithmen und Software in den Bereichen Gene-Ontology, phänotypische Analyse, Machine-Learning und Modellierung biologischer Netzwerke. Wir haben mehrere Kollaborationen mit biologischen Gruppen insbesondere zu humangenetischen Themen und bei der Analyse der molekularen Grundlagen der Frakturheilung. Unsere Gruppe ist ein multidisziplinäres Team von Informatikern, Bioinformatikern, Biologen und Ärzten.

Weitere Informationen und Links zu Software finden Sie auf unserer Website.

Ausgewählte Publikationen

Autoren:Robinson PN, Köhler S, Bauer S, Seelow D, Horn D, Mundlos S
Titel:The Human Phenotype Ontology: a tool for annotating and analyzing human hereditary disease.
Zeitschrift:Am J Hum Genet Jahr:2008; Volume:83Issue:(5):Seiten:610-5.

Autoren:Köhler S, Bauer S, Horn D, Robinson PN
Titel:Walking the interactome for prioritization of candidate disease genes.
Zeitschrift:Am J Hum Genet Jahr:2008; Volume:82Issue:(4):Seiten:949-58.

Autoren:Schulz MH, Bauer S, Robinson PN
Titel:The generalised k-Truncated Suffix Tree for time-and space-efficient searches in multiple DNA or protein sequences.
Zeitschrift:Int J Bioinform Res Appl Jahr:2008; Volume:4Issue:(1):Seiten:81-95.

Autoren:Grossmann S, Bauer S, Robinson PN, Vingron M
Titel:Improved detection of overrepresentation of Gene-Ontology annotations with parent child analysis.
Zeitschrift:Bioinformatics. Jahr:2007; Volume:23Issue:(22):Seiten:3024-31.

Autoren:Hecht J, Kuhl H, Haas SA, Bauer S, Poustka AJ, Lienau J, Schell H, Stiege AC, Seitz V, Reinhardt R, Duda GN, Mundlos S, Robinson PN
Titel:Gene identification and analysis of transcripts differentially regulated in fracture healing by EST sequencing in the domestic sheep.
Zeitschrift:BMC Genomics Jahr:2006; Volume:5Issue:(7):Seiten:172.

Autoren:Beattie BJ, Robinson PN
Titel:Binary state pattern clustering: a digital paradigm for class and biomarker discovery in gene microarray studies of cancer.
Zeitschrift:J Comput Biol Jahr:2006; Volume:13Issue:(5):Seiten:1114-30.

Autoren:Booms P, Ney A, Barthel F, Moroy G, Counsell D, Gille C, Guo G, Pregla R, Mundlos S, Alix AJ, Robinson PN
Titel:A fibrillin-1-fragment containing the elastin-binding-protein GxxPG consensus sequence upregulates matrix metalloproteinase-1: biochemical and computational analysis.
Zeitschrift:J Mol Cell Cardiol Jahr:2006; Volume:40Issue:(2):Seiten:234-46.

Autoren:Robinson PN, Böhme U, Lopez R, Mundlos S, Nürnberg P
Titel:Gene-Ontology analysis reveals association of tissue-specific 5' CpG-island genes with development and embryogenesis.
Zeitschrift:Hum Mol Genet Jahr:2004; Volume:13Issue:(17):Seiten:1969-78.

Autoren:Robinson PN, Wollstein A, Böhme U, Beattie B
Titel:Ontologizing gene-expression microarray data: characterizing clusters with Gene Ontology.
Zeitschrift:Bioinformatics Jahr:2004; Volume:20Issue:(6):Seiten:979-81.

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