Bioinformatik

Die Arbeitsgruppe Computational Biology und Bioinformatik  am Institut für Medizinische Genetik der Charité-Universitätsmedizin Berlin entwickelt Algorithmen und Software in den Bereichen Gene-Ontology, phänotypische Analyse, Machine-Learning und Modellierung biologischer Netzwerke. Wir haben mehrere Kollaborationen mit biologischen Gruppen insbesondere zu humangenetischen Themen und bei der Analyse der molekularen Grundlagen der Frakturheilung. Unsere Gruppe ist ein multidisziplinäres Team von Informatikern, Bioinformatikern, Biologen und Ärzten.

Weitere Informationen und Links zu Software finden Sie auf unserer undefinedWebsite.

Ausgewählte Publikationen

Zemojtel T, Köhler S, Mackenroth L, Jäger M, Hecht J, Krawitz P, Graul-Neumann L, Doelken S, Ehmke N, Spielmann M, Oien NC, Schweiger MR, Krüger U, Frommer G, Fischer B, Kornak U, Flöttmann R, Ardeshirdavani A, Moreau Y, Lewis SE, Haendel M, Smedley D, Horn D, Mundlos S, Robinson PN.
Effective diagnosis of genetic disease by computational phenotype analysis of the disease-associated genome.
Sci Transl Med 2014; 6(252):252ra123.
Robinson PN, Köhler S, Bauer S, Seelow D, Horn D, Mundlos S
The Human Phenotype Ontology: a tool for annotating and analyzing human hereditary disease.
Am J Hum Genet 2008; 83(5):610-5.
Köhler S, Bauer S, Horn D, Robinson PN
Walking the interactome for prioritization of candidate disease genes.
Am J Hum Genet 2008; 82(4):949-58.
Schulz MH, Bauer S, Robinson PN
The generalised k-Truncated Suffix Tree for time-and space-efficient searches in multiple DNA or protein sequences.
Int J Bioinform Res Appl 2008; 4(1):81-95.
Grossmann S, Bauer S, Robinson PN, Vingron M
Improved detection of overrepresentation of Gene-Ontology annotations with parent child analysis.
Bioinformatics. 2007; 23(22):3024-31.
Hecht J, Kuhl H, Haas SA, Bauer S, Poustka AJ, Lienau J, Schell H, Stiege AC, Seitz V, Reinhardt R, Duda GN, Mundlos S, Robinson PN
Gene identification and analysis of transcripts differentially regulated in fracture healing by EST sequencing in the domestic sheep.
BMC Genomics 2006; 5(7):172.
Beattie BJ, Robinson PN
Binary state pattern clustering: a digital paradigm for class and biomarker discovery in gene microarray studies of cancer.
J Comput Biol 2006; 13(5):1114-30.
Booms P, Ney A, Barthel F, Moroy G, Counsell D, Gille C, Guo G, Pregla R, Mundlos S, Alix AJ, Robinson PN
A fibrillin-1-fragment containing the elastin-binding-protein GxxPG consensus sequence upregulates matrix metalloproteinase-1: biochemical and computational analysis.
J Mol Cell Cardiol 2006; 40(2):234-46.
Robinson PN, Böhme U, Lopez R, Mundlos S, Nürnberg P
Gene-Ontology analysis reveals association of tissue-specific 5' CpG-island genes with development and embryogenesis.
Hum Mol Genet 2004; 13(17):1969-78.
Robinson PN, Wollstein A, Böhme U, Beattie B
Ontologizing gene-expression microarray data: characterizing clusters with Gene Ontology.
Bioinformatics 2004; 20(6):979-81.

Kontakt

Prof. Dr. med. Peter Robinson

Arbeitsgruppenleiter

CharitéUniversitätsmedizin Berlin

CVK: Campus Virchow-Klinikum

CharitéCentrum Frauen-, Kinder- & Jugendmedizin mit Perinatalzentrum & Humangenetik CC 17

Institut für Medizinische Genetik und Humangenetik

Bioinformatik

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